La BCL inizierà il 27 settembre con i round di qualificazione alla regular season. I round di qualificazione sono 2: il primo formato da 16 squadre che si affronteranno in due gare, andata e ritorno, e le 8 vincitrici andranno a giocare contro le squadre già inserite nel secondo round di qualificazione, formato da 8 squadre. Anche qui le compagini affronteranno la squadra con cui sono state accoppiate in due gare (andata e ritorno) e le 8 vincitrici prenderanno parte alla regular season.
Queste le squadre del primo round di qualificazione: Juventus (LTU); Kataja (FIN); Igokea (BIH); Rilski Sportist (BUL); Tsmoki Minsk (BLR); Donar Groningen (NED); KK Mornar Bar (MNE); Tartu Ulikool (EST); CS Minicipal Oradea (ROU); U-Mobitelco Napoca (ROU); BC Prievidza (SVK); Bakken Bears (DAN); Sodertalje Kings (SWE); FC Porto (POR); Benfica (POR); Petrolina AEK (CYP).
Secondo round di qualificazione: Lukoil Academic (BUL); Olaj (HUN); Proximus Spirou Charleroi (BEL); Besiktas Japan (TUR); Ironi Nahariya (ISR); Muratbey Usak Sportif (TUR); Openjobmetis Varese (ITA); MHP RIESEN Ludwigsburg (GER).
La regular season, invece, avrà inizio il 20 ottobre 2016; sarà composta da 32 squadre e queste sono le 24 già qualificate, in attesa delle 8 provenienti dai round di qualificazione: ASVEL Lyon Villeurbanne (FRA); SIG Basket Strasbourg (FRA); AS Monaco (FRA); Le Mans Sarthe (FRA); BK Banvit (TUR); Pinar Karsiyaka (TUR); Aris Tessaloniki (GRE); Sidigas Avellino (ITA); Fraport Skyliners (GER); EWE Baskets Oldenburg (GER); PAOK (GRE); Umana Reyer Venezia (ITA); BC Telenet Oostende (BEL); Maccabi Rishon Le Zion (ISR); Cibona Zagreb (CRO); CEZ Basketball Nymburk (CZE); Neptunas (LTU); Rosa Radom (POL); Helios Suns (SLO); Mega Leks (SRB); Iberostar Tenerife (ESP); Avtodor Saratov (RUS); BC Khimik (UCR); Ventspils (LAT).
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